染色质免疫共沉淀(CHIP)

染色质免疫共沉淀（ChIP）是研究蛋白质与 DNA 相互作用的经典技术：在活细胞状态下将蛋白质-DNA 复合物交联固定，把染色质随机打断为一定长度的片段，再通过特异性抗体免疫沉淀目的蛋白及其结合的 DNA 片段，经纯化与检测即可获得蛋白质与 DNA 互作的信息。

ChIP 广泛应用于转录调控、表观遗传学研究，可定位转录因子结合位点、解析组蛋白修饰分布，并可进一步结合 qPCR、测序（ChIP-seq）进行位点特异性或全基因组分析。

丰晖生物提供一站式 ChIP 服务，从抗体预实验、细胞培养与转染、交联与片段化、免疫沉淀到 PCR 检测全程标准化操作，原始数据与完整报告同步交付。

ChIP 技术的原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA 复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合物，特异性地富集目的蛋白结合的 DNA 片段，通过对目的片段的纯化与检测，从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。

图1 染色质免疫共沉淀（ChIP）原理示意图

天然 ChIP（N-ChIP）与交联 ChIP（X-ChIP）

N-ChIP 不使用固定剂使蛋白与染色质交联，而是从核酸酶消化的细胞核中分离天然染色质；抗体针对未固定的抗原产生，因而能更好地检测和结合靶标抗原，常用于组蛋白研究。但在染色质消化与免疫沉淀过程中，蛋白结合可能丢失，使数据出现偏差。

X-ChIP 使用甲醛等化学固定剂使目的蛋白与 DNA 交联，并通过超声处理或核酸酶消化进行染色质碎裂；其优势在于适用于组蛋白和其他蛋白，对细胞量的要求低于 N-ChIP，且能尽量减少染色质蛋白丢失、方便检测瞬时蛋白相互作用。

关键质控点

正式实验前需确认抗体级别：部分抗体达不到 ChIP 级别要求，需采购对应级别抗体，并通过阴阳性实验反馈结果可信性。同时还需确认染色质片段化程度——片段过大或过小都会影响富集效率与分辨率，需通过预实验摸索超声或酶消化条件。

下表为本项服务的常规工作环节与说明。样品状态、数量与实验方案确认后，我们会给出明确的时间安排。

以下为染色质免疫共沉淀（ChIP）的典型结果展示。

图一 ChIP 实验结果展示

染色质免疫共沉淀常需与其他核酸-蛋白互作检测联合使用。以下服务可组合开展：