Gene Synthesis

基因合成

全基因合成配免费密码子优化,上千种载体免费使用,大片段组装可达 200 kb

全基因合成
密码子优化
大片段组装
上千种载体免费

基因合成(化学法)是获得目的基因的重要技术途径。相较于从天然生物体分离、扩增基因,化学基因合成不依赖核酸模板,不受天然基因来源约束,可人工构建任意序列的目标基因,广泛用于难以获取基因的制备、蛋白表达优化与序列改造研究。

丰晖生物提供一站式基因合成服务,覆盖序列分析与密码子优化、片段合成与组装、克隆构建、测序验证等环节,全流程标准化操作,原始数据与完整报告同时交付,确保数据真实可靠。

对于高 GC、低 GC、重复结构与超长序列,我们通过分段合成与最优连接方案控制合成难度,并依据序列特点匹配相应感受态细胞,以提高一次合成的成功率。

核心应用场景:

  • 难获取基因 — 无法从天然来源克隆或转录本稀少的基因
  • 表达优化 — 通过密码子优化提升异源宿主中的蛋白表达量
  • 序列改造 — 人工构建突变、融合、截短或标签化序列
  • 元件与文库构建 — 合成启动子、sgRNA 靶点等定制序列元件

提示:高度重复、极端 GC 或具潜在毒性的序列可能影响合成与克隆效率。建议在委托前提供完整序列信息,我们会先做可行性评估并给出替代方案。

DNA 合成通常采用固相亚磷酰胺法:将 DNA 链固定在不溶性固相载体上,从 3' 端向 5' 端延伸,每延伸一个核苷酸通过一个精确的「四步循环」完成。

四步循环:

  • 脱保护 — 移除固相载体上末端核苷酸 5'-羟基的 DMT 保护基,暴露 5'-OH
  • 偶联 — 活化后的亚磷酰胺与 5'-OH 缩合,形成新的亚磷酸三酯键
  • 加帽 — 乙酸酐在 N-甲基咪唑催化下乙酰化未参与偶联的残留 5'-OH,永久终止未延伸链,避免产生缺失一个碱基的 n-1 短链杂质
  • 氧化 — 将亚磷酸三酯氧化为稳定的磷酸三酯,为下一轮脱保护提供稳定环境

完成一个循环,DNA 链即延长一个核苷酸,循环次数等于目标 DNA 的碱基数。合成结束后,将 DNA 链从固相载体上切割下来并脱除所有保护基团,即得到纯净的 DNA 片段。

长片段基因的组装

化学合成单次可合成的 DNA 长度有限(通常小于 200 bp)。对于更长的基因,通常采用重叠延伸 PCR:先合成一系列带有互补重叠区的小片段,再通过 PCR 反应将各片段拼接为全长基因。

密码子优化

同一氨基酸在不同宿主中的密码子偏好性不同。密码子优化即优先使用宿主偏好密码子、规避稀有密码子,以提升目标序列在指定宿主中的表达。主要优化参数包括密码子偏好性、GC 含量、酶切位点(删除)、poly 结构与序列重复等。丰晖生物提供免费密码子优化。

🎯

合成长度可达 200 kb

自研大片段 DNA 合成组装系统,支持超长基因与复杂结构组装

🔬

上千种载体免费使用

覆盖常用表达、标签与报告载体,可直接选用并免费使用

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免费密码子优化

按宿主偏好优化序列,降低合成难度并提升蛋白表达量

📊

复杂序列方案成熟

针对高低 GC、重复结构与特殊元件有对应策略与感受态选择

🧪

全流程标准化质控

片段与终产物均经测序验证,原始数据与完整报告同时交付

1

序列分析与优化

审核目标序列,开展密码子优化与酶切位点、重复结构等可行性分析

2

分段合成

将长序列划分为可合成片段,逐段进行寡核苷酸合成

3

片段组装与克隆

通过重叠延伸 PCR 或重组方式拼接片段并克隆入目标载体

4

转化与筛选

转化感受态细胞,挑取单克隆后进行筛选

5

测序验证与交付

全长测序核验序列,制备质粒与甘油菌并出具报告

下表为本项服务的常规工作环节与说明。样品状态、序列长度与实验方案确认后,我们会给出明确的时间安排。

服务内容工作说明
序列分析与密码子优化审核序列可行性,按宿主偏好开展免费优化
片段合成与组装分段合成寡核苷酸,经重叠延伸 PCR 拼接为全长基因
克隆构建与转化筛选克隆入目标载体并挑取单克隆筛选
测序验证与报告出具全长测序核验序列,制备质粒与甘油菌并出具报告

合成难度较高的序列(高 GC、重复结构、特殊元件等)需先做评估,我们会在方案确认时说明可行的合成策略。

交付内容说明
液体质粒默认 20μl,浓度大于 200 ng/μl,未去内毒素,不可直接转染细胞
甘油菌液默认 300μl,附相应抗性信息,便于后续扩增与保存
质粒图谱与测序文件提供质粒图谱与测序文件,确认序列与原设计一致
空载对照随附空载对照质粒,便于后续转染与表达对照
完整实验报告含序列优化说明、合成与构建流程及测序结果

以下为合成目的基因并构建表达载体的典型结果示例。

案例说明:合成人源 OASL(NM_003733.4)基因并构建于 pcDNA3.1-EGFP 载体,经全长测序确认序列与设计一致。

基因合成的成败与序列特点密切相关,以下要点有助于提高一次合成的成功率:

1
提供完整准确的序列信息 — 请提供目标序列、载体要求与宿主信息,便于评估合成难点并制定优化策略。
2
复杂结构需先评估 — 高低 GC、重复结构与发夹结构会增加合成难度,我们会采用分段合成并选择最优连接方案,如酶切连接、多段重组等。
3
特殊元件匹配专用菌株 — 针对 CCDB、LTR 等特殊元件,我们会更换与之匹配的特定感受态细胞,如抗 CCDB 的 DB3.1 与重组缺陷型的 Stbl 系列。
4
毒性或不稳定序列的处理 — 若基因不稳定或具毒性导致常规克隆菌致死、引入随机突变或缺失,我们会尝试不同的感受态细胞以完成构建。
5
默认质粒不可直接转染 — 默认交付的液体质粒为未去内毒素规格,浓度大于 200 ng/μl;如需转染请提前说明,我们可提供更高规格的质粒抽提。
6
密码子优化默认免费 — 我们按指定宿主免费开展密码子优化,降低合成难度并提高蛋白表达量。

Q基因合成与从天然来源克隆有什么区别?

基因合成不依赖核酸模板,也不受天然基因来源约束,可人工构建任意序列的目标基因,尤其适合难以获取或需要改造优化的基因;从天然来源克隆则需要先获得含目的基因的模板。

Q可以合成多长的基因?

常规采用分段合成结合重叠延伸 PCR 拼接,自研大片段 DNA 合成组装系统合成长度可达 200 kb。具体可行长度与序列复杂度相关,建议先提供序列做可行性评估。

Q密码子优化收费吗?

免费。我们会根据目标宿主(如大肠杆菌、哺乳动物细胞)的密码子偏好性进行优化,并兼顾 GC 含量、酶切位点、poly 结构与序列重复等参数。

Q合成的基因一定能表达吗?

密码子优化可提升表达的可行性,但蛋白表达还受载体、启动子、宿主与培养条件等影响。我们可提供优化建议或配套构建表达载体,进一步提高表达成功率。

Q交付的质粒可以直接转染细胞吗?

默认交付的液体质粒为未去内毒素规格,不建议直接转染。如需转染或蛋白表达,请下单时说明,我们可提供更高规格的质粒抽提。

Q涉及高 GC 或重复序列的基因能合成吗?

多数可以。针对高低 GC、重复结构与较长序列,我们通常采用分段合成并选择最优连接方案;对特殊元件还会匹配相应的感受态细胞,建议先提供序列评估难度。

Q合成周期多长?

具体周期与基因长度、序列复杂度及所需处理方案有关。样品与序列方案确认后,我们会给出明确的时间安排。

需要基因合成服务?

提供目标序列、载体与宿主信息,我们完成密码子优化、拼接合成长片段基因并测序核验,交付质粒、菌液与完整报告

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