一、贴壁细胞转染操作步骤
1. 贴壁细胞接种
转染前一天将细胞接种到相应的培养板中,以转染时细胞汇合度达到30-50%为宜,见表1。
表1. 转染前一天推荐接种的细胞数
96-well
接种细胞数量:0.5 x 104 ± 0.25 x 104
每孔表面积:0.3 cm2
培养基体积:0.2 ml
24-well
接种细胞数量:2.5 x 104 ± 1 x 104
每孔表面积:1.9 cm2
培养基体积:0.5 ml
12-well
接种细胞数量:5 x 104 ± 2 x 104
每孔表面积:3.8 cm2
培养基体积:1 ml
6-well / 3.5cm
接种细胞数量:1.5 x 105 ± 5 x 104
每孔表面积:9.4 cm2
培养基体积:2ml
6 cm培养皿 / T25
接种细胞数量:4 x 105 ± 1 x 105
每孔表面积:25 - 28 cm2
培养基体积:5ml
10 cm培养皿 / T75
接种细胞数量:1 x 106 ± 2.5 x 105
每孔表面积:75 - 78.5 cm2
培养基体积:10ml
14 cm培养皿 / T175
接种细胞数量:2 x 106 - 5 x 106
每孔表面积:153 - 175 cm2
培养基体积:20 ml
2. 贴壁细胞转染
为了提高转染效率,建议siRNA/miRNA浓度范围为10nM至100nM,FTLiRNA™用量与siRNA/miRNA浓度和培养皿规格进行匹配,见表2。
表2. 贴壁细胞推荐转染条件
96-well
siRNA/miRNA 终浓度:10-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:2-20pmol /0.032-0.32ug
完全培养基体积:150 ul
无血清培养基:50 ul
培养基总体积:200ul
20uM母液体积:0.1-1ul
FTLiRNA™体积:0.2-3ul
24-well
siRNA/miRNA 终浓度:10-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:5-50pmol /0.08-0.8ug
完全培养基体积:400 ul
无血清培养基:100 ul
培养基总体积:500ul
20uM母液体积:0.25-2.5ul
FTLiRNA™体积:0.5-7.5ul
12-well
siRNA/miRNA 终浓度:10-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:10-100pmol /0.16-1.6ug
完全培养基体积:800 ul
无血清培养基:200 ul
培养基总体积:1ml
20uM母液体积:0.5-5 ul
FTLiRNA™体积:1-15ul
6-well
siRNA/miRNA 终浓度:10-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:20-200pmol /0.32-3.2ug
完全培养基体积:1.8 ml
无血清培养基:200 ul
培养基总体积:2ml
20uM母液体积:1-10 ul
FTLiRNA™体积:2-30ul
6 cm
siRNA/miRNA 终浓度:10-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:50-500pmol /0.8-8ug
完全培养基体积:4.6 ml
无血清培养基:400 ul
培养基总体积:5ml
20uM母液体积:2.5-25ul
FTLiRNA™体积:5-75ul
10 cm
siRNA/miRNA 终浓度:10-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:100-1000pmol /1.6-16ug
完全培养基体积:9.5 ml
无血清培养基:500 ul
培养基总体积:10ml
20uM母液体积:5-50ul
FTLiRNA™体积:10-150ul
2.1 siRNA/miRNA配置
将siRNA/miRNA用RNase-free H2O配制成20uM储存液以供后续使用,配置体系见表3。
表3. 20uM siRNA/miRNA储存液的配置方法
注:1OD=2.5nmols=40ug
2.2 转染操作(以24孔板转染10nM的siRNA为参考)
- 将0.25ul 20uM的siRNA双链加入到100 ul无血清培养基或Opti-MEM中,用移液枪轻轻吹打3~5次混匀。
- 向上述100 ul混合物中加入0.75ul的FTLiRNA™,并立即涡旋振荡10s进行混匀。
- 室温孵育10min使双链siRNA和FTLiRNA™形成转染复合物,孵育时间不要超过30min。
- 与此同时,吸弃培养皿中的原培养液,换成0.4 ml预热的新鲜含血清的完全培养基。
- 将步骤3中孵育好的100 ul转染复合物加入到换液后的待转染孔中,一字法轻摇细胞板混匀。每孔中培养基的最终体积为500 ul,siRNA终浓度为10nM。
- 转染后细胞放置于培养箱中正常培养。
- 24~72 h后,qPCR及Western Blot检测siRNA干扰效果。
注:针对比较敏感细胞,建议转染后4-6h进行一次换液。
二、悬浮细胞转染
1. 悬浮细胞接种
为了使用FTLiRNA™转染悬浮细胞取得最佳的转染效果,与常规培养条件相比,应在转染当天减少培养基体积接种细胞,可以使用半液转染法。对于不同规格的培养板,建议接种的细胞数量及完全培养基体积,见表4。
表4. 转染当天悬浮细胞接种量
96-well
接种细胞数量:1 x 104 - 2 x 104
接种细胞悬液体积:50 ul
24-well
接种细胞数量:1 x 105 - 2 x 105
接种细胞悬液体积:150 ul
12-well
接种细胞数量:2 x 105 - 4 x 105
接种细胞悬液体积:300 ul
6-well / 3.5 cm
接种细胞数量:5 x 105 - 2 x 106
接种细胞悬液体积:800ul
2. 悬浮细胞转染
针对悬浮细胞,为了达到较高的转染效率,建议使用20 nM-100nM的高siRNA/miRNA浓度范围进行转染摸索,同时适当提高转染试剂FTLiRNA™的使用量,具体各指标参考数据见表5。
表5. 悬浮细胞推荐转染条件
96-well
siRNA/miRNA终浓度:20-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:2-10pmol/0.032-0.16ug
细胞悬液体积:50ul
无血清培养基:50ul
转染总体积:100ul
20uM母液使用量:0.1-0.5ul
FTLiRNA™体积:0.2-1.5ul
6h后补液体积:100ul
24-well
siRNA/miRNA终浓度:20-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:5-25 pmol/0.08-0.4ug
细胞悬液体积:150ul
无血清培养基:100ul
转染总体积:250ul
20uM母液使用量:0.25-1.25ul
FTLiRNA™体积:0.5-3.75ul
6h后补液体积:250ul
12-well
siRNA/miRNA终浓度:20-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:10-50pmol/0.16-0.8ug
细胞悬液体积:300ul
无血清培养基:200ul
转染总体积:500ul
20uM母液使用量:0.5-2.5 ul
FTLiRNA™体积:1-7.5ul
6h后补液体积:500ul
6-well
siRNA/miRNA终浓度:20-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:20-100pmol/0.32-1.6ug
细胞悬液体积:800ul
无血清培养基:200ul
转染总体积:1ml
20uM母液使用量:1-5ul
FTLiRNA™体积:2-15ul
6h后补液体积:1ml
6 cm
siRNA/miRNA终浓度:20-100nM
siRNA/miRNA物质的量/质量:50-250pmol/0.8-4ug
细胞悬液体积:2ml
无血清培养基:500ul
转染总体积:2.5ml
20uM母液使用量:2.5-12.5 ul
FTLiRNA™体积:5-37.5ul
6h后补液体积:2.5ml
3. 转染操作(以24孔板转染100nM的siRNA为参考)
- 将1.25ul 20uM的siRNA双链加入到100ul无血清培养基或Opti-MEM中,用移液枪轻轻吹打3~5次混匀。
- 向上述100ul混合物中加入3.75ul的FTLiRNA™,并立即涡旋振荡10s进行混匀。
- 室温孵育10min使双链siRNA和FTLiRNA™形成转染复合物,孵育时间不要超过30min。
- 将步骤3中孵育好的100 ul转染复合物加入到150ul含血清完全培养基的细胞悬液待转染孔中,一字法轻摇细胞板混匀。每孔中培养基的最终体积为250ul,siRNA终浓度为100nM,6h后补液250ul。
- 转染后细胞放置于培养箱中正常培养。
- 24~72 h后,qPCR及Western Blot检测siRNA干扰效果。
注:针对比较敏感细胞,建议转染后4-6h进行一次换液。
三、疑难解答
转染效率低
解决建议
· 增加每孔中siRNA浓度。
· 增加每孔中FTLiRNA™的量。
· 检测转染24h~96h的不同时间点的沉默效率。
· 用Opti-MEM稀释siRNA。
· 确保贴壁细胞在转染当天汇合度达到30-50%。对于小细胞和生长缓慢的细胞类型,每孔中接种约2倍数量的细胞以达到足够的汇合度。
· 确认所有试剂是否不含RNase。
· 确保siRNA是高质量的(PAGE纯化和脱盐)。
· 确认siRNA双链体的浓度和退火条件。
· 将转染期间的培养基体积减少一半并低速离心培养板(180g,5分钟),4小时后加入0.5毫升培养基。
细胞毒性大
解决建议
· 通过在转染后4至6小时更换培养基或简单地向培养基中添加新鲜培养基,减少FTLiRNA™/siRNA复合物与细胞的孵育时间。
· 减少转染试验中使用的FTLiRNA™的体积。
· 核实沉默靶基因后是否影响细胞活力。